鸭ChREBP基因多态性与血清生化指标关联性分析  

李万贵1,2 , 张依裕1,2 , 潘兰兵1,2
1 贵州大学动物科学学院,贵州贵阳,550025
2 高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室,贵州贵阳,550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 114 篇   
收稿日期: 2014年05月01日    接受日期: 2014年06月06日
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摘 要

鸭ChREBP(carbohydrate response element binding protein,碳水化合物反应元件结合蛋白),是鸭糖酵解脂肪酸从头合成的重要调节因子之一,对调节机体糖脂代谢平衡有重要作用;本研究以PCR-SSCP结合直接测序对三穗鸭、兴义鸭、樱桃谷鸭3个鸭品种ChREBP 基因外显子1236910111213进行多态性检测,分析SNPs位点与血清生化指标的关联性及对各指标的加、显性效应;结果显示,仅在樱桃谷鸭的外显子9中检测到了g.246911 G>A突变,表明鸭ChREBP基因具有良好的保守性,产生了AAABBB三种基因型,AB两个等位因,BBB分别为该位点的优势等位基因和优势基因型,其频率为0.5750.450多态信息含量(PIC)为0.369属于中度多态,卡方(χ2)检验发现,该g.246911 G>A突变位点的基因型分布在樱桃谷鸭群体中严重偏离了Hardy-Weinberg平衡,可能是因为长期人工选择的原因,关联性分析结果表明,AA基因型个体的血清生化指标除低密度脂蛋白没有达到显著水平外,其他指标均显著地高于BB基因型个体(P<0.05),加、显性效应显示,该位点对总蛋白、白蛋白、球蛋白、高密度脂蛋白、低密度脂蛋白、总胆固醇具有显著的加性效应(P<0.05),对总蛋白和白蛋白有显著的负显性效应(P<0.05);推测g.246911 G>A为有利突变,AAA分别为有利基因型和等位基因,可作为今后选育优秀生长性状樱桃谷鸭的遗传标记位点。  

关键词
鸭;ChREBP;血清生化指标;SNPs
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基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
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