茂原链霉菌DSM 40847全基因组测序及序列分析  

肖前程1 , 彭思露1 , 李尔汉1 , 朱笃1,2 , 杨慧林1,2
1 江西师范大学生命科学学院,江西省亚热带植物资源保护与利用重点实验室,南昌,330022
2 江西科技师范大学生命科学学院,江西省有机功能分子重点实验室,南昌,330013
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 113 篇   
收稿日期: 2014年05月02日    接受日期: 2014年06月04日
© 2014 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要

茂原链霉菌(Streptomyces mobaraensis)是一种高GC含量的革兰氏阳性放线菌,它广泛用于生产转谷氨酰胺酶、博来霉素、莫能霉素等。目前,还没有相关研究报道茂原链霉菌的全基因组序列,这限制了基于功能基因挖掘和利用的定向育种以及分子遗传研究。本研究首次通过高通量测序技术对茂原链霉菌DSM 40847进行全基因组测序,使用Velvet软件进行拼接得到266 contigs,整个基因组大小约7.5 Mbp,GC含量为73.2%,序列已提交至美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库。通过对基因组序列进行分析,成功鉴定转谷氨酰胺酶酶原激活相关蛋白基因,同时对该菌株的次级代谢产物合成基因簇进行了预测,相关研究结果将为茂原链霉菌的功能基因组学研究提供基础数据。

关键词
茂原链霉菌;全基因组测序;转谷氨酰胺酶;基因簇
本文全文 PDF 和全文 HTML 正在制作中
基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
阅览选项
. 全文 PDF
读者评论
. 评论
作者的其他论文
.
肖前程
.
彭思露
.
李尔汉
.
朱笃
.
杨慧林
相关论文
.
茂原链霉菌
.
全基因组测序
.
转谷氨酰胺酶
.
基因簇
服务
. 发表评论