李万贵^1,2 , 张依裕^1,2 , 潘兰兵^1,2 , 林家栋^1,2 , 李思^1,2

1 贵州大学动物科学学院,贵阳,550025
2 高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室,贵阳,550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 132 篇   
收稿日期: 2014年05月08日    接受日期: 2014年06月04日

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采用PCR-SSCP结合DNA直接测序技术检测107只樱桃谷鸭和133只三穗鸭SCD1基因5'调控区g.936399~>g.936799区域的SNPs，并分析其与血清生化指标及肉质的关联性；结果显示，2个SNPs被检测到，分别为g.936516 C>G和g.936551 T>C，樱桃谷鸭SCD1基因5' 调控区g.936399~>g.936799区域共产生5种基因型AA、BB、CC、AC和BC，三穗鸭共6种基因型，较樱桃谷鸭多了AB基因型，3个等位基因A、B和C，樱桃谷鸭和三穗鸭中，优势基因型均为BB，频率分别为0.719 6 和0.500，优势等位基因B，频率分别为0.785和0.693 2，樱桃谷鸭AC基因型个体最少，频率分为0.037 4，三穗鸭AA 基因型个体最少，频率为0.022 7，樱桃谷鸭和三穗鸭多态信息含量(PIC)分别为0.327 2和0.42，均属中度多态(0.25<PIC<0.5)，A等位基因频率均最小，分别为0.074 8和0.113 6，樱桃谷鸭群体基因型分布高度偏离了Hardy-Weinberg平衡(p＞0.05)，三穗鸭群体基因型分布未偏离Hardy-Weinberg平衡(p＜0.05)。关联分析显示，该基因多态座位的BC基因型的甘油三酯(TG)显著高于CC和BB基因型(p<0.05)，其它各基因型、性状间均未达到显著差异水平(p>0.05)；认为该多态座位可能是调控鸭脂肪沉积的一个分子标记辅助选择位点；对樱桃谷鸭的SNPs 与肉质的关联分析显示，CC型个体表现出了较差的保水性。

鸭；SCD1基因；血清生化指标；SNPs