控制水稻抽穗期和株高的QTL的定位及遗传分析  

邱磊 , 蒋海潮 , 冯玉涛 , 高冠军 , 张庆路 , 何予卿
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室, 国家植物基因研究中心(武汉), 国家农作物分子育种中心, 武汉, 430070
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 97 篇   
收稿日期: 2014年05月07日    接受日期: 2014年06月11日
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摘 要

抽穗期(heading data, HD)和株高(plant height, PH)是水稻(Oryza sativa L.)非常重要的农艺性状。本研究利用金23B (Jin23B)和青谷矮1号(QGA-1)构建的BC3F1群体及其衍生的BC3F2群体通过分子标记定位水稻抽穗期和株高的QTL (quantitative trait locus)。构建的遗传连锁图包含105 对SSR标记和8对InDel标记,图谱较好地覆盖了水稻12条染色体。两年来共定位到了9个抽穗期相关QTLs,6个株高相关的QTLs,其中抽穗期和株高最大效应都来源于第7染色体。抽穗期QTLqHD7-3在2011年LOD为37.07,可以解释的表型贡献率为41.05%,加性效应为11.68;株高QTL qPH7-2在2011年LOD为43.73,可以解释的表型贡献率为54.17%,加性效应为21.60;2012年LOD为42.66,可以解释的表型贡献率为54.39%,加性效应为19.95。qHD7-3和qPH7-2位于同一区域RM214-RM5543之间,Ghd7也位于这一区间,该QTL可能是Ghd7的等位基因。抽穗期QTLqHD2定位于第2染色体上标记ZH282和RM71之间,在两年内都能检测到,其LOD值分别为4.56和4.99,可解释的表型贡献率分别为4.31%和7.99%株高QTLqPH4定位于第4染色体上标记RM241和RM317之间,其两年内的LOD分别为2.89和2.67,解释的表型贡献率为9.42%和8.78%。抽穗期QTLqHD2和株高QTLqPH4所定位的区间没有相关的基因或QTL报道,这两个QTL可能含有控制抽穗期和株高的新基因。本研究通过遗传定位证明了株高和抽穗期是由主效QTL和微效QTL共同控制的,并发掘了新的抽穗期和株高的QTL,为育种家利用分子标记辅助选择培育新品种提供更多的选择。

关键词
水稻;抽穗期株高;QTL定位
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基因组学与应用生物学
• 第 33 卷
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