周龙武¹ , 徐正银² , 唐瑶¹ , 吕榜丽² , 李建勇² , 司慧娟¹ , 温荣辉¹ , 陈保善^1,3

1广西大学生命科学与技术学院, 南宁, 530005
2广西大学农学院, 南宁, 530005
3亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室(广西大学), 南宁, 530005
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 129 篇   
收稿日期: 2014年09月02日    接受日期: 2014年10月16日

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近年来，高粱花叶病毒(sorghum mosaic virus, SrMV)已成为危害广西甘蔗的主要病原病毒，但尚未见侵染本地区甘蔗的SrMV全基因组序列的报道。本研究以田间一株感染SrMV的甘蔗为材料，提取叶片总RNA，通过RT-PCR及RACE技术扩增获得9 626 nt (不包括polyA尾)的病毒全长基因组序列，命名为SrMV-GX。序列分析表明，SrMV-GX与浙江萧山分离物(SrMV-XoS)、浙江余杭分离物(SrMV-YH)和美国德克萨斯州分离物(SrMV-H)的核苷酸同源性分别为95.4%、94.7%和80.9%；编码的多聚蛋白氨基酸同源性分别为97.8%、98.4%和90.4%。与马铃薯Y病毒科的其它成员一样，SrMV-GX基因组中存在一个小的ORF (pretty interesting potyviridae ORF, pipo)，且其序列非常保守。本研究对SrMV-GX进行序列分析，为进一步研究SrMV的遗传多样性，改进现有的检测方法及培育健康脱毒甘蔗种苗提供理论依据。

高粱花叶病毒；全基因组；序列分析；pipo基因