梅步俊 , 王志华

1河套学院农学系, 巴彦淖尔, 015000; 2河套学院土木工程系, 巴彦淖尔, 015000
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 165 篇   
收稿日期: 2014年10月03日    接受日期: 2014年10月30日

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 为了剔除畜禽全基因组关联分析结果中的假阳性结果，寻找最优的假设检验方法、解决畜禽全基因组关联分析中的多重比较问题，本研究将现有GWAS研究中常用的七种假设检验方法和贝叶斯因子法进行比较。通过对模拟数据和公开数据集的研究，结果表明：畜禽全基因组关联分析中用贝叶斯因子法进行假设推断，其优良的统计性能与假设检验数目(SNP数)和最小等位基因频率(MAF)基本无关，其在假设检验中的某些表现优于其它几种基于p值(p-value)的方法。本研究为进一步解决畜禽全基因组关联分析中的多重比较问题奠定了基础。

 

畜禽；全基因组关联分析；贝叶斯因子；多重比较；多重检验；假设检验