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基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 169 篇
收稿日期: 2014年10月02日 接受日期: 2014年10月28日
超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD,EC1.15.1.1)是广泛存在于生物体的重要抗氧化酶之一,在抵御过多活性氧簇(Reactive oxygen species,ROS)对机体毒害的过程中起重要作用。研究采用RT-PCR及RACE方法,首次从草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肝胰脏中克隆了Cu/Zn-SOD全长cDNA。该Cu/Zn-SOD cDNA (GenBank 登录号:GU901214) 全长725 bp,包括完全开放阅读框(ORF)465 bp,5’端非编码区(5’-UTR)为18 bp,3’-UTR为242 bp。其ORF编码154个氨基酸,分子量约为15.93 kD,理论等电点为5.57。序列比较表明,草鱼Cu/Zn-SODcDNA的推测氨基酸序列与其他多种动物的一致性较高,其一致性为57.8%~96.8%;同时,具有Cu/Zn-SOD家族保守的4个Cu2+结合位点即组氨酸H-47, -49, -64, -121和4个锌离子结合位点即H-64, -72, -81及天冬氨酸D-84,一对二硫键即两个半胱氨酸残基C-58,-147及蛋白家族标签序列45“GFHVHAFGDNT”55与139“GNAGGRLACGVI”150。应用实时荧光定量PCR检测了草鱼Cu/Zn-SOD mRNA组织表达特征。结果显示,Cu/Zn-SOD mRNA在草鱼所检测的11种组织器官内均有表达,但差异很大;其中在肝中的表达水平显著高于其他组织(P<0.05),而在脂肪中表达丰度最低(P<0.05)。该研究结果将有助于进一步探讨鱼类Cu/Zn-SOD基因的结构与功能,并为研究其抗氧化分子机理奠定基础。