严婉荣 , 肖彤斌 , 赵志祥 , 肖敏 , 陈绵才

海南省农业科学院农业环境与植物保护研究所, 海南省植物病虫害防控重点实验室, 海口, 571100
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 178 篇   
收稿日期: 2014年10月02日    接受日期: 2014年10月27日

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MicroRNAs (miRNAs)是一类特殊的、具有沉默作用的小分子RNA，其序列在植物中具有高度保守性。本文通过下载已知的植物成熟miRNA数据库和辣椒的表达序列标签（EST）、基因组测序序列（GSS）及核酸数据库（nr），利用生物信息学方法对辣椒的miRNA进行了预测与分析。通过二级结构筛选，最终得到11条保守性候选序列，这些辣椒新miRNA中，有5条来自EST数据库，2条来自GSS数据库，4条来自nr数据库。且11条前体均可折叠形成标准的miRNA家族二级结构。通过比对，在nr数据库中发现了与病毒相关的25条靶序列。同时，对miRNA与植物病毒的关系进行了论述。

辣椒；MicroRNA；病毒；数据库