福建农林大学动物科学学院, 福州, 350002
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 156 篇
收稿日期: 2014年07月30日 接受日期: 2014年09月28日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2014 年, 第 33卷, 第 156 篇
收稿日期: 2014年07月30日 接受日期: 2014年09月28日
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摘 要
采用磁珠富集法从AFLP片段中筛选微卫星标记,并对5个福建地方鸭品种的遗传多样性进行检测。基因组DNA用EcoRⅠ/MseⅠ内切酶酶切的同时与接头连接,酶切连接产物与用生物素标记的探针杂交,应用磁珠捕获100~2 000 bp含有微卫星序列的DNA片段并通过pGEM-T载体转化到大肠杆菌DH5α感受态细胞中,构建富集微卫星序列的基因组文库。随机挑选46个阳性克隆,测序获得14条含有微卫星的DNA序列并递交到GenBank (登录号: FJ599499~FJ599512)。设计合成14对微卫星引物,通过PCR优化从中选择5对引物用于5个福建地方鸭品种的遗传多样性分析。结果显示,5对微卫星引物共检测到31个等位基因,各微卫星基因座的有效等位基因数为1.969 7~2.834 4,多态信息含量和杂合度的平均值分别为0.513 3和0.748 0,遗传多样性丰富,说明磁珠富集法适合用于鸭微卫星标记的分离与筛选,筛选得到的5个微卫星位点可作为有效的遗传标记用于福建省地方鸭品种遗传多样性的研究。
关键词
鸭;磁珠富集;微卫星;遗传多样性
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