几种植物类伐昔洛韦水解酶基因的生物信息学分析  

巴德仁贵 , 李爽 , 王绍萌 , 马勇 , 哈斯阿古拉
内蒙古大学生命科学学院/内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室, 呼和浩特, 010021
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 61 篇   
收稿日期: 2015年01月01日    接受日期: 2015年01月30日
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摘 要

以拟南芥和蓖麻为重点,利用生物信息学对不同植物的类伐昔洛韦水解酶(valacyclovir hydrolase-like , VACVase-Like)蛋白的理化性质、亲疏水性、信号肽、导肽、跨膜结构域、保守结构域、二级结构及三级结构等进行预测和分析,并构建了该家族系统发生树。结果表明,除了可可树属于稳定蛋白外,其余均属于不稳定蛋白。该基因家族均含有明显的信号肽、导肽、跨膜结构和亲疏水结构,且结构组成上相似,属于分泌蛋白,但是对亚细胞定位分析发现,在不同植物中存在和发挥功能部位均不相同。分析结果可为植物VACVase-like的研究提供有价值的信息,为进一步研究其在植物体内的功能和作用机理提供依据。

关键词
伐昔洛韦;类伐昔洛韦水解酶;生物信息学;α/β水解酶
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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