张春蕾 , 沙伟 , 张梅娟 , 索荔 , 周伯

齐齐哈尔大学生命科学与农林学院, 齐齐哈尔, 161006
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2014年12月03日    接受日期: 2015年01月01日

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本研究我们试图利用PCR技术从砂藓中克隆TIR1基因的cDNA 全长序列，对其进行了生物信息学分析，采用实时荧光定量PCR分析该基因在复水和干旱过程的表达情况。我们将砂藓转录组测序获得的生长素受体蛋白基因序列命名为RcTIR1，基因cDNA全长为1 110 bp，开放阅读框(ORF)长度为615 bp，共编码204个氨基酸。生物信息学分析显示，该基因所编码蛋白理论等电点为5.70，不稳定指数为32.85，总平均亲水性为-0.027，无跨膜区和信号肽，亚细胞定位在细胞核。利用实时荧光定量PCR方法检测对该基因在砂藓复水和快速干旱过程中的表达模式显示在砂藓的复水过程和干旱处理中该基因均有差异性表达。通过研究砂藓生长素受体蛋白基因RcTIR1与砂藓干旱胁迫的关系，为植物逆境胁迫机制的研究以及该基因的实际应用奠定基础。

砂藓；RcTIR1；基因克隆；表达分析