陈攀峰 , 丰继华 , 单增辉 , 魏恨恨 , 胡焕

云南民族大学电气信息工程学院, 昆明, 650500
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 29 篇   
收稿日期: 2014年12月03日    接受日期: 2015年01月01日

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我们在对染色质修饰作用进行研究的过程中，发现以往的研究只关注化学修饰间的线性关系，而对于非线性关系未充分重视。为此，我们对Pokholok等人测出的酵母组蛋白甲基化修饰与乙酰化修饰数据进行了插值处理，得到了16种全基因组组蛋白修饰数据。然后对每组修饰数据在TSS位点上、下游各取1000bp进行对齐、平均、平滑和归一化处理。我们发现，根据酵母基因转录水平数据，可将组蛋白修饰数据分为两大类:一类是转录增强修饰群体，一类是转录抑制或转录无关修饰群体。为了揭示不同转录活性基因上修饰间的复杂关系，我们分别利用Pearson相关分析法和David N. Reshef等人提出的MINE算法得到了以上修饰之间的相关性。最后对该结果进行分析，得到了修饰之间的一些非线性关系，同时发现同群体间修饰的关联性更强。

组蛋白修饰；Pearson相关分析法；MINE算法