潘虹¹ , 刘瑞弘¹ , 文奇¹ , 刘琴¹ , 周银古¹ , 熊英²

1新余市疾病预防控制中心, 新余, 338000; 2江西省疾病预防控制中心, 新余, 338000
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 39 篇   
收稿日期: 2015年01月01日    接受日期: 2015年01月30日

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因HA 基因的头部重链区（HA1）是流感病毒的抗原位点和受体结合位点，所以了解流感病毒的HA1基因特性可以评估当前WHO推荐的疫苗株的预防效果。本文选取新余市2013-2014年通过狗肾传代细胞(MDCK)培养分离到的H1N1流感毒株12株，提取病毒RNA，反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增HA1基因片段。对序列分析发现2013-2014年新余市甲型H1N1流感病毒HA1基因序列与疫苗推荐株有较高的同源性，核苷酸同源性97.9%~98.5%。2013年的6株毒株HA1区与疫苗株比较，氨基酸变异位点7-11个，其中3株有2个变异位点在不同的抗原决定簇区。而2014年毒株单独集中在进化树的一支。以上提示，目前流感疫苗对2014年的流感人群仍有保护作用，对2013年的部分流行的H1N1预防效果有限；甲型H1N1爆发流行的可能性很大，应加强防控。

H1N1 甲型流感病毒；血凝素基因；进化分析