药用资源与天然药物化学教育部重点实验室, 西北濒危药材资源开发国家工程实验室, 陕西师范大学生命科学学院, 西安, 710062
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 59 篇
收稿日期: 2015年01月01日 接受日期: 2015年01月30日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 59 篇
收稿日期: 2015年01月01日 接受日期: 2015年01月30日
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摘 要
分析丹参转录组数据库(SRX021907),得到一条R2R3-MYB基因,blast比对发现该基因为丹参SmMYB7(KF059361.1)。分别从gDNA和cDNA水平克隆该基因全长,测序结果表明该基因与公布序列一致,分析发现该基因无内含子序列,包含一个长为954 bp的开放读码框(ORF),编码317个氨基酸残基。多重序列比对和系统进化树分析显示SmMYB7蛋白与拟南芥AtMYB73同属R2R3-MYB第22个亚家族。已有丹参基因信息结合BD walking获得1974 bp的启动子序列,分析结果表明多种顺式作用元件存在于该基因的启动子区。实时荧光定量PCR分析显示,该基因的表达为组成型,在丹参根、茎、叶、花中都表达;随着花的发育,该基因的表达量逐渐增加;此外,SmMYB7在盐胁迫、水杨酸、茉莉酸甲酯和脱落酸处理下表达均上调,推测该基因参与调控植物防御和花的发育。
关键词
丹参;SmMYB7;生物信息学分析;表达模式分析
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