重度肥胖患者肠道内机会性致病菌Escherichia coli微多样性分析  

赵梅1 , 王睿瑞2 , 徐佳2 , 方超1 , 赵宇峰1,2
1上海交通大学系统生物医学研究院, 上海, 201100; 2上海交通大学生命技术学院微生物代谢国家重点实验室, 上海, 201100
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 40 篇   
收稿日期: 2015年01月01日    接受日期: 2015年01月30日
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摘 要

本研究利用志贺氏菌显色培养基和ERIC-PCR指纹图谱技术,从一名重度肥胖患者肠道内分离出19种不同ERIC类型的分离物。选取不同ERIC类型的代表菌株进行16S rRNA基因分子鉴定并构建系统发育树,发现19种代表菌株的16S rRNA基因和埃希氏菌属Escherichia、志贺氏菌属Shigella的相似性达到99%。经生理生化反应鉴定,19种代表菌株均为肠杆菌科的肠埃希氏菌Escherichia coli。体外生物学分析发现19种E.coli代表菌株在生化特性、耐药性、毒性方面有明显差异。本研究表明来自一名重度肥胖患者肠道内同一种群的E.coli在菌株水平上具有丰富的微多样性,不同ERIC类型的E.coli在生理生化特性上存在较大的差异,且部分菌株具有潜在致病性。

关键词
机会性致病菌;肠埃希氏菌;微多样性;肥胖症
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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