梭梭肌动蛋白基因HaACT1全长的克隆与表达分析  

杜辉辉 1,3 , 姚正培1 , 王泽3 , 麻浩2,3 , 张桦1,3
1新疆农业大学农学院, 乌鲁木齐, 830052; 2南京农业大学农学院, 南京, 210095; 3新疆农业大学干旱区荒漠研究所, 乌鲁木齐, 830052
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 89 篇   
收稿日期: 2015年01月06日    接受日期: 2015年02月05日
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摘 要

      根据本室已克隆得到的梭梭肌动蛋白基因HaACT1部分序列,通过5’RACE技术获得HaACT1的cDNA全长序列。序列分析表明,该基因cDNA全长序列1534 bp,其中5’UTR序列为75 bp,3’UTR序列为325 bp,开放阅读框序列为1134 bp,编码376个氨基酸。该序列与GenBank中收录的其它植物Actin基因核苷酸序列的相似性均在84 %以上,并且它们的氨基酸序列的相似性达95 %以上,GenBank登录号为KM886609。根据得到的cDNA序列设计全长引物,进一步克隆了HaACT1的基因组DNA序列,由4个外显子和3个内含子组成。利用半定量和绝对荧光定量PCR对HaACT1的表达进行分析,发现该基因在梭梭的不同组织及各种非生物胁迫下均能稳定表达,适合作为梭梭中其他功能基因表达研究中的内参基因。

关键词
梭梭;肌动蛋白基因;克隆;表达分析
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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