苏小娟^1,2 , 刘广达^1,2 , 刘英^1,2 , 冯晓宇^1,2 , 陈贵林^1,2

1内蒙古大学生命科学学院, 呼和浩特, 010021; 2内蒙古自治区中蒙药材规范化生产工程技术研究中心, 呼和浩特, 010021
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基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 60 篇   
收稿日期: 2015年01月01日    接受日期: 2015年01月30日

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被子植物线粒体cox1基因的GroupI内含子常含有水平基因转移(horizontal gene transfer, HGT)现象。本研究对药用寄生植物锁阳(Cynomorium songaricum)线粒体基因cox1、cox2、nad1序列进行扩增分析，利用最大似然法对cox1和cox2基因内含子和外显子分别进行聚类分析，结果显示cox1内含子聚类结果与其他3个聚类结果不相符，说明该内含子可能存在水平基因转移现象。对比了锁阳6个不同居群间线粒体基因cox1、cox2、nad1外显子与内含子序列平均距离，发现6个不同居群间cox1基因内含子同源性高达100%，说明该基因内含子可能具有功能。结合生物信息学分析表明该内含子很有可能编码核酸内切酶，而DNA核酸内切酶被认为能促进内含子的转移。3'Co-conversion tracts(CCT)是被子植物内含子发生转移的痕迹, 对锁阳cox1基因序列进行检测发现其含有3'CCT序列且长度为35bp，RT-PCR实验验证得到cox1基因内含子可以独立转录mRNA。因此，锁阳cox1基因内含子很可能编码一个核酸内切酶，且促进了其内含子的转移。

线粒体基因；内含子；水平基因转移；序列分析；锁阳