杨国环 , 王正 , 吴玲玉 , 张雪洪 , 黄显清

上海交通大学生命科学技术学院, 微生物代谢国家重点实验室, 上海, 200240
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 106 篇   
收稿日期: 2015年02月05日    接受日期: 2015年02月27日

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假单胞菌株H78是本实验室从油菜根际分离得到的一株生防细菌。通过16s rRNA及藤黄绿菌素 (Pyoluteorin，Plt)合成基因pltC基因（编码聚酮合成酶）保守区段进行PCR测序，初步确定H78菌株可能属于P. protegens。本研究旨在进一步克隆H78菌株的Plt生物合成基因簇，分析其Plt合成特性以及H78菌株的分类地位。对假单胞菌株H78进行全基因组de novo测序；使用blast工具，分析假单胞菌株H78与P. protegens Pf-5，CHA0, P. aeruginosa M18, LESB58中Plt合成基因簇的同源性；使用KMB培养基对菌体进行发酵，测定菌体生长, 对Plt合成进行HPLC测定。假单胞菌H78的Plt合成基因簇与其它四个菌株都存在保守的基因组成与布局，在Plt合成基因编码氨基酸序列上，H78与CHA0、Pf-5菌株的一致性高达99%~100%，其中与CHA0同源性更高；而与铜绿假单胞菌M18及LESB58菌株的一致性相对较低，为52%~88%。在KMB培养基中，假单胞菌株H78中累积合成Plt超过30μg mL^-1。H78菌株属于P. protegens，其Plt合成基因簇与P. protegens Pf-5、CHA0具有高度同源性，而铜绿假单胞菌M18、LESB58的Plt基因簇存在不同的进化起源；H78菌株能合成较高水平的Plt, 通过进一步研究改造，此菌有潜力成为安全并高效合成Plt的生防菌株。

假单胞菌(P. protegens) H78；藤黄绿菌素；生物合成基因簇