1新疆农业大学林业研究所, 乌鲁木齐, 830052; 2新疆农业大学科学与技术学院, 乌鲁木齐, 830052
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 94 篇
收稿日期: 2015年01月06日 接受日期: 2015年01月30日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 94 篇
收稿日期: 2015年01月06日 接受日期: 2015年01月30日
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摘 要
以荒漠地区极为抗旱、耐热的超旱生固沙植物梭梭为材料,利用Solexa测序技术对高温和适温下野生梭梭的枝条进转录组测序和数据de novo组装。将得到的unigene进行功能注释、分类及代谢通路分析。结果表明,获得长度大于200 bp差异表达基因162 504条,将得到的unigene与Nr和Swiss-Prot数据库比对后发现,分别有38 529条和23 198条unigene与其它物种的基因具有同源性。利用COG数据库可将有关的13 012条梭梭unigene分成25类,KEGG数据库分析发现共有22 249个unigene参与298种代谢通路。本研究表明梭梭逆境胁迫反应是一个多基因参与、多个生物过程协同调控的过程,基因表达量的变化可能是调控的主要方式,为揭示梭梭耐旱机理以及梭梭耐旱性相关关键基因奠定了基础。
关键词
梭梭;逆境;Illumina测序;基因表达谱
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