家兔UCP2基因多态性的筛选和生物信息学研究  

李维1 , 刘若余1 , 冯艳青3 , 李思1 , 杜雪琴2 , 谢海强1 , 肖超能1 , 林家栋1
1贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室, 贵州大学动物科学学院, 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室, 贵阳, 550025; 2贵阳市花溪区第三实验学校, 贵阳, 550006; 3贵州铜仁万山区农牧科技局, 铜仁, 554300
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 109 篇   
收稿日期: 2015年01月01日    接受日期: 2015年01月30日
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摘 要

本研究兔的UCP2基因的多态性,为地方兔种的选种和选育提供一定的依据。分别以比利时兔、加利福尼亚兔和新西兰兔构建其DNA池,设计6对引物扩增3个兔种UCP2基因的外显子序列和部分内含子序列,用PCR产物直接进行双向测序快速的筛选出兔的UCP2的多态位点。结果:在兔UCP2基因中帅选到8个多态性位点:intron2-G2217T、exon3-A63C、exon3-G169A 、intron5-C61A、exon6-C11G、intron6-C7T、intron6-C46T、intron6-C73A ,其中exon3-A63C和exon3-G169A位于第3外显子上,且exon3-A63C 为错义突变,导致编码的酪氨酸(Tyr)变为丝氨酸(Ser)。exon6-C11G在第6外显子上,其余的多态位点都在内含子中,除了intron6-C7T外,其余的多态位点在三种兔种中都有。结论:通过生物信息学对兔UCP2基因的分析发现mRNA二级结构、二级结构和蛋白质的三级结构在突变前后都发生变化。

关键词
UCP2基因;比利时兔;新西兰兔;加利福尼亚兔;SNPs
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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