威宁绵羊和贵州半细毛羊STAT5b基因部分外显子SNP研究  

王振1 , 申小云2,3 , 盘道兴1 , 谢海强1 , 孙岩岩1 , 刘若余1
1贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室, 贵阳, 550025; 2贵州省扶贫办公室外资项目管理中心, 贵阳, 550004
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 145 篇   
收稿日期: 2015年03月02日    接受日期: 2015年03月24日
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摘 要

为给贵州本地绵羊选种选育提供更好的科学依据,本试验利用威宁绵羊和贵州半细毛羊构建DNA池,设计4对引物扩增其STAT5b基因部分外显子及内含子序列。PCR产物经纯化后进行双向测序。利用DNAStar和BLAST分析确定多态性位点。利用生物信息学软件分析SNPs位点对STAT5b基因RNA二级结构、STAT5b蛋白二级及三级结构的影响。结果表明,在扩增的STAT5b基因中筛选到6个SNPs:exon5-G12A、exon8-G56A、exon8-C104T、intron2-A3164C、intron4-C1026T和intron5-T3323C,其中exon8-G56A为错义突变,导致编码的谷氨酸(Glu)变为赖氨酸(Lys);exon5-G12A和exon8-C104T多态位点均未改变氨基酸的编码,为同义突变;intron2-A3164C、intron4-C1026T和intron5-T3323C均在内含子区,不参与氨基酸编码。

关键词
STAT5b;SNPs;贵州半细毛羊;威宁绵羊
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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