海南医学院海南省热带药用植物研究开发重点实验室, 海口, 571199
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 165 篇
收稿日期: 2015年03月02日 接受日期: 2015年03月31日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 165 篇
收稿日期: 2015年03月02日 接受日期: 2015年03月31日
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摘 要
为了建立适合南药益智的ITS-PCR体系来研究不同地理居群益智遗传多样性。利用植物基因组试剂盒法提取益智基因组DNA为模板,采用单因素和正交试验对ITS-PCR过程中的关键影响因素进行优化,并对ITS-PCR产物进行测序鉴定。实验结果表明最佳ITS-PCR反应体系(25 μL)为:Taq酶1.0 U,dNTPs 4 mmol/L,Mg2+ 0.5 mmol/L,引物2.0 μmol/L,模板20 ng,10×PCR Buffer (不含Mg2+) 2.5 μL;最佳扩增程序为:94℃预变性2 min;94℃变性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,共32个循环;最后72℃延伸5 min。采用该最佳体系对益智基因组DNA进行PCR扩增,获得扩增产物经单向测序获得了益智ITS部分序列。建立了稳定的ITS-PCR体系,为研究益智遗传多样性分析奠定了基础。
关键词
益智;ITS-PCR;体系优化;正交设计
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