大豆miR172家族成员序列及表达模式初步分析  

王涛 , 李永光 , 李文滨
大豆生物学教育部重点实验室/农业部东北大豆生物学与遗传育种重点实验室, 东北农业大学, 哈尔滨, 150030
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 198 篇   
收稿日期: 2015年04月01日    接受日期: 2015年04月30日
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摘 要

MicroRNAs (miRNAs)在植物的生长发育以及植物对环境的适应方面发挥了重要的作用,成为近几年研究的热点。miR172家族是一个保守的miRNA家族,之前的研究表明miR172的作用涉及生长期过渡、闭花受精、花器官发育、开花时间调控等方面。但是到目前为止,人们对大豆miR172家族的了解还不是很清楚。本实验通过miRBase、PLACE数据库及DNAman软件对gma-miR172家族成员的前体序列、成熟序列、启动子序列进行比较分析,发现gma-miR172家族成员成熟序列虽然高度保守,但前体序列具有一定的差异,这可能导致了各成员的功能差异;启动子分析显示其启动子含有光反应原件和多种非生物胁迫响应元件,推测其可能参与大豆的开花调控和逆境胁迫响应。通过实时定量PCR分析了大豆miR172成员的组织特异性表达情况。利用PMRD数据库对gma-miR172的靶基因进行了生物信息学分析,获得了7个AP2-like类转录因子,参与花器官发育、开花时间调控及非生物胁迫响应的方面。上述结果初步分析了大豆miR172家族的功能与靶基因,对今后进一步分析研究大豆miR172家族及其靶基因打下了基础。

关键词
大豆;miR172;序列分析;靶基因
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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