韩立敏

陕西学前师范学院 生物科学与技术系, 西安, 710062
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 182 篇   
收稿日期: 2015年04月01日    接受日期: 2015年04月30日

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通过分析菘蓝转录组数据库得到一条牦牛儿基牦牛儿基焦磷酸合成酶（GGPPS）的编码序列，利用RT-PCR扩增得到其全长，命名为IiGGPPS1，利用生物信息学方法对该基因及其编码的蛋白进行分析，并对该基因的功能、表达特性进行了研究。研究结果表明：IiGGPPS1的cDNA序列全长为1086 bp，开放阅读框长1080 bp，编码359个氨基酸。IiGGPPS1蛋白与其他植物GGPPSs高度保守，蛋白N端含有叶绿体信号肽，二级结构主要由螺旋和无规则卷曲组成，同源建模结果显示IiGGPPS1蛋白是个同源二聚体。组织特异表达分析表明该基因在叶片中的表达量最高，根中次之，茎中最低，且受虫害颜色浅的叶片中该基因表达量显著低于正常叶片中的表达量，推测该基因可能与二萜化合物叶绿素的合成相关。该结果将为进一步研究菘蓝牦牛儿基牦牛儿基焦磷酸合成酶基因（IiGGPPS1）的功能及其表达调控奠定理论基础，也可为菘蓝的生长、发育调节与品质改良积累研究资料。

菘蓝；牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶；克隆；生物信息学分析；组织表达特性