贵州地方山羊ADAMTS1基因序列多态性及生物信息学研究  

孙振梅1,2 , 陈祥1,2 , 龙威海1,2 , 许厚强1,2 , 冯文武1,2 , 李鹏程1,2
1贵州大学动物科学学院, 贵阳, 550025; 2高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 186 篇   
收稿日期: 2015年04月01日    接受日期: 2015年04月30日
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摘 要

选择黔北麻羊和贵州黑山羊为试验对象,分别构建DNA池,结合PCR产物直接测序法分析两品种中ADAMTS1基因外显子2~8中可能与繁殖性状相关的单核苷酸多态位点。结果表明在黔北麻羊和贵州黑山羊两个群体中共检测到ADAMTS1基因的10个SNPs位点,其中该基因第2、5、6外显子中各存在1个SNP位点,依次是C266T、T2210C、C2513A,均引起所编码氨基酸的同义突变,第3、4、6、8内含子中各存在1个SNPs位点,依次是C1073T、A1326G、G2698A、T4261A,第7内含子中同时存在3个SNPs位点,为T3401C、T3045T、T3064C,其中9个SNPs位点(C266T, C2513A, C1073T, A1326G, G2698A, T4261A, T3401C, T3045G, T3064C)为两品种所共有,T2210C仅存在黔北麻羊中。位点A1326G的A和G等位基因频率在检测的两个羊种间差异较大,通过后续的生物信息学分析显示,ADAMTS1基因外显子2的C266T和外显子6的优势突变C2513A的位点变异共同引起mRNA二级结构发生显著改变。

关键词
黔北麻羊;贵州黑山羊;SNPs;ADAMTS1;外显子
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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