水稻(Oryza sativa L.)潜在内源性致敏原的生物信息学筛选与分析  

朱方超1,2 , 贾瑞宗2 , 徐林2 , 郭运玲2 , 孔华2 , 郭安平2
1海南大学农学院, 海口, 670228; 2中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海口, 571101
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 203 篇   
收稿日期: 2015年04月01日    接受日期: 2015年04月30日
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摘 要

食物中的蛋白质是最常见的食入性致敏原。为了对水稻中的内源性致敏原有一个全面的认识和了解,利用全序列比对的方法比较了水稻蛋白与已知致敏原之间的序列相似性,获得了水稻潜在致敏原,并对其保守结构域、分子功能、系统发育和染色体分布进行了分析和描述。结果一共发现了122个水稻潜在致敏蛋白,其中包括了22个已被数据库收录的水稻致敏原;保守结构域分析显示它们分别属于37个蛋白家族,其中的HATPase_c_3Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPasePF13589结构域未在已知致敏原中发现;系统发育分析则分别揭示了水稻Prolamin蛋白超家族和DnaK蛋白家族的多样性;而且致敏蛋白在水稻染色体上有成簇状分布的趋势。

关键词
水稻;致敏原;保守结构域;交叉反应性
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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