基于LC-MS-MS技术建立水稻细菌性条斑病菌的蛋白质表达谱的研究  

朱平川1 , 覃宏平2 , 付珊2 , 岑卫健1 , 邹海凡2 , 何勇强1,2 , 姜伟1,2
1亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广西大学, 南宁, 530004; 2广西大学生命科学与技术学院, 南宁, 530004
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 192 篇   
收稿日期: 2015年04月01日    接受日期: 2015年04月30日
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摘 要

水稻细菌性条斑病菌(Xamthomonas. oryzaepv. oryzicolaXoc)是水稻的主要病原菌之一, 其引发的水稻细菌性条斑病可造成水稻严重减产。本文利用Xoc GX01作为实验菌株,通过细菌培养、蛋白提取、纯化获得总蛋白,利用高pH值C18反相色谱作为第一维分离方式,再将收集的馏分通过LC-MS/MS技术得到了总蛋白质表达谱,共鉴定蛋白质1621个,同时利用生物信息学技术对鉴定蛋白进行基因本体(Gene Ontology GO)生物学分类,对生物功能、生物进程以及细胞组件进行了注释。为明确植物病原菌的作用机理和研究植物-病原微生物互作提供了方法学基础。

关键词
水稻细菌性条斑病菌;LC-MS/MS;蛋白质表达谱;基因本体
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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