关岭牛MyoD基因原核表达载体的构建及生物信息学分析  

夏丹1 , 许厚强1 , 陈伟1,2 , 陈祥1 , 周迪1 , 张雯1 , 桓聪聪2 , 赵焕平1 , 张青青1 , 孙成娟1
1高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室, 贵州大学动物科学学院, 贵阳, 550025; 2贵州大学生命科学学院, 贵阳, 550025
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 219 篇   
收稿日期: 2015年06月01日    接受日期: 2015年06月30日
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摘 要

实验采用RT-PCR方法克隆关岭牛MyoD基因的CDS区,利用EcoRⅠ、XhoⅠ酶对目的片段与PET32a(+)原核表达载体进行酶切,T4连接酶连接过夜,通过转化,测序,构建重组表达载体,并对该基因进行相关生物信息学分析。实验结果获得了关岭牛MyoD基因CDS区,成功构建了PET-32a(+)-MyoD重组表达载体。MyoD基因编码区为954bp,编码318个氨基酸,共有31个稀有密码子,表达蛋白大小为34.2kD。该蛋白为水溶性蛋白,等电点PI=5.8在体内带负电,二级结构中α-螺旋、无规则卷曲较多。蛋白没有信号肽和明显的跨膜区,为胞内蛋白,主要存在于细胞核中。重组载体表达的MyoD蛋白带有His等标签,蛋白大小为53.6 kD,共497个氨基酸。实验对关岭牛MyoD蛋白的理化性质、结构特点进行了初步分析,以期为研究牛MyoD蛋白特性及其作用机制奠定理论基础。

关键词
关岭牛;MyoD基因;原核表达载体;生物信息学
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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