基于生物信息学方法的FOX基因家族对比分析  

常凯 , 熊怡淞 , 曲远青 , 吴艾霖 , 陈清红 , 吴丽娟
中国人民解放军成都军区总医院实验医学中心 高湿医学全军重点实验室, 成都, 610083[基金项目:本研究由国家自然科学基金(81302596)资助]
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 309 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

以FOXA,FOXO和FOXP为核心,利用生物信息学方法对比分析FOX家族成员的分子特征、启动子、蛋白理化性质、蛋白结构、亚细胞定位,构建分析蛋白三维模型并绘制家族系统进化树。结果表明:FOX家族的核酸序列相似性较低,FOXP和FOXN序列内含较多内含子,但仍具有溯源性。蛋白的脂肪族氨基酸指数介于49.71到76.11,分子量介于29084到79586.1,较为离散。GRAVY值介于-0.764到-0.179,蛋白均表现为亲水性。pI值在亚家族间非常稳定,可作为蛋白分类的辅助指标。对比统计FOX蛋白高级结构各亚家族的保守结构域和功能位点,可见功能域的差异导致了其调节途径的多样。分析结果可为FOX蛋白的研究提供有价值信息,为进一步研究FOX在人体内的疾病发生途径与作用机理提供依据。

关键词
叉头框基因家族;生物信息学;对比分析;分子特征;蛋白特征
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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