粟艳琼 , 邹联斌 , 胡杰 , 张步娴 , 屈素洁 , 莫胜兰

广西壮族自治区动物疫病预防控制中心, 南宁, 530001
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 312 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

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本研究于2009至2014年间在广西南宁、防城港和梧州三市活禽交易市场中分离获得12株H6亚型禽流感病毒(AIV)毒株。通过RT-PCR、序列测定及基因序列分析，结果表明，扩增获得的12株毒株基因大小均为1701bp，与GenBank中所登录的HA基因大小一致；其氨基酸序列推导结果发现12株分离毒株裂解位点氨基酸序列均为PQIETRG，只含有一个碱性氨基酸，符合低致病禽流感病毒的特点；对糖基化位点进行分析，结果发现HA基因中存在8个潜在糖基化位点，其中只有毒株GX2161的182aa~184aa处发生了交替，其氨基酸序列为R-N-T，这与高致病力毒株的R-X-R/K-R的分子特征不同，推测GX6121毒株可能为典型的低致病力毒株。12个分离毒株与GenBank中公开登录的其他20个H6亚型AIV毒株的遗传进化树分析表明，防城港的4株毒株与越南株LC050583处于同一分支上，梧州的3株毒株与越南株LC042081处于同一分支，表现出较明显的地域性，而由于地理位置的影响，南宁的5株毒株则与越南株LC050583、广西株HQ599858、JX304770形成三个分支，表现出较近亲缘性，这表明AIV中HA存在一定的遗传变异性。本研究在分子水平上为有效防控广西活禽市场中H6亚型AIV的感染提供参考。

禽流感；HA基因；H6亚型；遗传变异