芝麻RSAP-PCR反应体系的正交优化与验证  

孙建1 , 颜廷献1 , 涂玉琴1 , 乐美旺1 , 饶月亮1 , 雷刚2,3 , 颜小文1 , 周红英1
1江西省农业科学院作物研究所, 国家油料改良中心南昌分中心, 南昌, 330200; 2江西省农业科学院蔬菜花卉研究所, 南昌, 330200; 3江西农业大学农学院, 南昌, 330045
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 333 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

限制性位点扩增多态性(RSAP)是一种新型分子标记技术。为获得适用于芝麻的RSAP-PCR的反应体系,本研究通过L16(45)正交设计与单因素试验相结合的方法,对PCR反应体系中模板DNA、Mg2+、dNTPs、引物和Taq DNA聚合酶等影响因素进行了试验优化。结果表明,芝麻RSAP-PCR的最佳反应体系为:在15 μL反应体系中,30 ng模板DNA、2.0 mmol/L的Mg2+、0.3 mmol/L的 dNTPs、0.6 μmol/L的引物和1.0 U的Taq DNA聚合酶。利用17个芝麻品种对该体系进行了稳定性验证和多态性检测,结果表明,该反应体系稳定、可靠,29对随机引物组合共扩增DNA条带454条,每对引物扩增8-21条,平均15.66条,多态性比例为0-56.25%,平均25.77%。利用普通芝麻与有限生长习性芝麻构建的F2分离群体对RSAP标记进行了初步遗传验证,结果表明,F2群体植株中出现了亲本位点的分离。该RSAP-PCR反应体系的建立与优化为芝麻遗传多样性分析、连锁图谱构建和分子标记辅助育种提供了新技术。

关键词
芝麻;RSAP;正交优化;体系验证
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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