东北地区戊型肝炎病毒基因特征分析  

朱光泽1,2 , 屈勇刚2,3 , 李一权2 , 兰添2 , 范园园2 , 尹秀英2 , 金宁一2
1长春中药大学附属医院检验科, 长春, 130021; 2军事医学科学院 军事兽医研究所, 长春, 130122; 3石河子大学, 石河子, 832003
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 332 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

为探索东北地区戊型肝炎病毒(HEV)流行背景和特征,本实验用抗-HEV抗体酶联免疫试剂盒检测了不同样品血清中的抗体;对样品用RT-PCR检测HEV RNA,对PCR阳性产物进行克隆测序,然后对序列进行分析。对49个呈RNA阳性的样品进行了序列测定,结果显示HEV分离株之间核苷酸同源性为82.2%~100.0%,与基因I、II 、III 和IV型的其他戊型肝炎病毒毒株的同源性分别为75.6%~81.6%、77.7%~80.9%、73.6%~81.0%和80.9%~95.7%。针对吉林省内的人源HEV序列与动物源HEV序列的比较结果显示,同源性在86.2%~100.0%之间,其中有5对序列完全相同。本研究获得的44个核酸片段结合HEV基因IV型中已知亚型的12个基因序列进行了亚型分类。结果44个核酸片段对应3个分支,包括IVa 、IVb亚型及另一支独立分支,表明该独立分支中的分离株可形成一个新的亚型,本研究中将其命名为IVh亚型。我国东北地区主要流行的HEV基因型为IV型,并且人源HEV与动物源HEV有极高的同源性,同时还发现我国东北地区流行着国内已有报道的IVa 、IVb亚型外,存在着一个新的亚型。

关键词
戊型肝炎病毒;基因型;同源性
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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