杨金宏 , 孔卫青

安康学院 陕西省蚕桑重点实验室, 安康, 725000
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 322 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

根际细菌丰富多样，对植物的生长发育有重要影响。为更好的了解野生蒙桑和移植栽培蒙桑根际细菌的多样性组成和差异，本研究提取了两样本的宏基因组DNA，利用Roche 454 GS FLX测序技术对样本菌群的16S rRNA基因的V1~V3区域进行测序。测序结果表明：野生蒙桑根际细菌的主导类群为变形菌门(31.62%)和酸酐菌门(19.8%)；栽培蒙桑的主导类群为厚壁菌门(89.07%)，两样本的沙浓指数分别为5.8和1.33。栽培蒙桑样本OTU498的基因序列数占总样本的78.9%，其最相近菌属为苏云金芽孢杆菌；野生蒙桑OTU656、OTU556、OTU568和OTU665占总样本的8.17%，最相近菌属是丝状共生菌。进化分析发现两样本菌群具有各自的特异性，大都来源于同一菌门的不同菌属，分别聚类。本研究表明移栽后蒙桑根际细菌的多样性降低，主导类群也发生了变化，基于16S rRNA测序可以揭示根际细菌的组成结构。

蒙桑；根际细菌；16S rRNA；多样性