广西巴马小型猪MCP-1、MMP-9基因启动子区SNP位点与动脉粥样硬化相关血清指标的关联分析  

周亭亭 , 徐文文 , 程晓芳 , 宋少锐 , 蒋钦杨 , 郭亚芬 , 兰干球 , 蒋和生
广西大学动物科学技术学院, 南宁, 530004
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 346 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

本文目的是分析广西巴马小型猪MCP-1和MMP-9基因启动子区SNP位点与血清指标的关联性,筛选可能与患动脉粥样硬化高风险的分子标记,为后续培育广西巴马小型猪动脉粥样硬化疾病模型易感家系打下基础。采用PCR-RFLP对90头正常饲喂的广西巴马小型猪的MCP-1和MMP-9基因启动子区SNP位点进行分型,统计该位点的基因型频率和等位基因频率,比较分析基因型频率与动脉粥样硬化相关血清指标的关联性。结果显示,广西巴马小型猪MMP-9基因-1267位点、-1287位点和MCP-1基因-1782位点均存在3种基因型:AA型、AG型和GG型。MCP-1基因-1782位点和MMP-9基因-1267位点以GG型为优势基因型,MMP-9基因-1287位点以AG型为优势基因型。MMP-9基因两个突变位点的各基因型个体的血清指标及其分析值之间差异均不显著。MCP-1基因-1782位点AG型个体血清LDL平均值和LDL/HDL比值均显著高于GG型个体(P<0.05),AG型个体HDL和TC浓度均值、AI值稍高于GG型个体,但差异均不显著。MCP-1基因AG型个体患动脉粥样硬化疾病的风险高,可作为培育建模易感家系的分子标记。

关键词
广西巴马小型猪;MCP-1;MMP-9;SNP;动脉粥样硬化
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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