戚文华¹ , 蒋雪梅² , 甘丽萍¹ , 杜联明³

1重庆三峡学院生命科学与工程学院, 重庆, 404100; 2重庆三峡学院化学与环境工程学院, 重庆, 404100; 3 四川大学生命科学学院, 四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室, 成都, 610064
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基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 365 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

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GC含量是基因组核酸序列组成的重要特征，其含量的变化与所在基因的起源、进化和功能变异等密切相关。本研究从共享数据库获取牛、绵羊和山羊各条染色体序列，搜索和统计其染色体序列GC含量，并与染色体序列微卫星数量、丰度和密度等变量进行相关性分析。结果表明，牛科同物种不同染色体序列GC含量具有显著差异（t-test，P < 0.05），而不同物种（牛、绵羊和山羊）染色体序列GC含量相互比较无显著差异（t-test，P > 0.05）。牛和山羊染色体序列GC含量分布基本一致，它们GC含量最多的均是25号染色体，其次是19号和18号染色体，最少的是6号染色体。绵羊GC含量最多的是24号染色体，其次是11号和14号染色体，最少的也是6号染色体。通过Kendall's tau-b 和 Spearman's rho检验表明，牛、绵羊和山羊不同染色体序列SSRs数量与染色体序列长度呈高度正相关（P < 0.01），而与其染色体上GC含量呈中度负相关（P < 0.01）。牛、绵羊和山羊不同染色体上SSRs丰度和密度与其染色体序列GC含量呈负相关（P < 0.05），而与其染色体序列长度无相关性（P > 0.05）。

牛；绵羊；山羊；染色体序列；GC含量；微卫星