宗地花猪和从江香猪ADRP基因多态性及生物信息学分析  

顾丽菊1,2 , 任丽群1,2 , 燕志宏1,2 , 张依裕1,2 , 宋高翔1,2 , 田松军3 , 刘华钧4 , 杨秀江4 , 杨通斌4
1贵州大学动物科学学院, 贵阳, 550025; 2高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室, 贵阳, 550025; 3 贵州省紫云自治县畜牧兽医局, 紫云, 561000; 4 贵州省从江县畜牧局, 从江, 557400
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 367 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

为研究宗地花猪和从江香猪ADRP基因的单核苷酸多态性,为选种选育提供理论参考,试验以宗地花猪和从江香猪为对象,构建DNA池,采用PCR产物测序法对ADRP基因8个外显子进行单核苷酸多态性检测,并利用生物信息学方法对ADRP基因编码产物进行结构功能预测。结果显示,在两个猪种ADRP基因中筛查到5SNPs,分别是T37CT140CG777AA1061GA1117G,其中T37C位于非编码区内,T140CA1061G为同义突变,G777A (Val→Ile)和A1117G (Asn→Ser)为错义突变;突变前后ADRP基因mRNA二级结构、编码蛋白二级结构及三级结构均发生了变化。研究结果表明,宗地花猪和从江香猪ADRP基因具有较高的遗传多样性,可为猪种的选育和创新提供参考。

关键词
宗地花猪;从江香猪;ADRP;外显子;SNPs
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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