果蔗拔地拉及其芽变株系的SCoT、BPS和URP联合鉴定  

刘俊仙1,2 , 熊发前3 , 刘欣1,2 , 刘丽敏1,2 , 罗丽4 , 刘红坚1,2 , 余坤兴1,2 , 淡明1,2 , 卢曼曼1,2 , 何毅波1,2 , 李松1,2
1广西农业科学院甘蔗研究所, 南宁, 530007; 2广西蔗糖产业协同创制中心, 南宁, 530007; 3广西农业科学院经济作物研究所, 南宁, 5300074; 4广西农业科学院农业科技信息所, 南宁, 530007
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 18 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

前期我们获得了果蔗拔地拉的4份自然芽变株系,本研究旨在揭示果蔗拔地拉及其芽变株系在DNA水平上的分子差异,为从果蔗自然突变株中鉴定出芽变品种提供分子证据。综合采用基于单引物扩增反应的三种分子标记技术(SCoT、BPS和URP)的20条单引物对果蔗拔地拉及其芽变株系进行分子鉴定。结果表明:1)在随机使用的3条SCoT标记单引物、5条BPS标记单引物和12条URP标记单引物中,BPS9、URP6R和URP17R这三条单引物扩增失败,未能扩增出任何条带,剩下的17条单引物共扩增产生了89条条带,17条单引物中平均每条单引物扩增出5.24条条带。2)SCoT标记单引物和BPS标记单引物均未能扩增产生出明显的可重复差异条带,只有URP标记单引物URP38F能扩增产生一条由亮度强弱及有无同时存在引起的可重复差异条带,该条带大小约625 bp左右,该条单引物及其所产生的约625 bp大小的条带的亮度强弱及有无可用于果蔗拔地拉及其芽变株系的分子鉴定。结果显示,1)在本次研究中,3条SCoT标记引物和5条BPS标记单引物均未能扩增产生出明显的可重复差异,不能在DNA水平上对果蔗拔地拉及其芽变株系进行分子鉴定,2)但URP标记单引物URP38F能扩增产生一条由亮度强弱及有无同时存在引起的可重复差异条带,该条带大小约625 bp左右,该条单引物及其所产生的625 bp大小的条带可用于果蔗拔地拉及其芽变株系的分子鉴定,能有效区分果蔗拔地拉及其芽变株系在DNA分子水平上显示出来的微小的遗传差异。

关键词
甘蔗;果蔗拔地拉;芽变株系;分子鉴定;SCoT;BPS;URP;分子标记
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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