张步娴 , 邹联斌 , 胡杰 , 粟艳琼 , 屈素洁 , 莫胜兰

广西壮族自治区动物疫病预防控制中心, 南宁, 530001
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 17 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

2009年至2014年间我单位在广西南宁、防城港和梧州三市活禽交易市场进行流行病学调查时，在鸭咽喉和泄殖腔拭子中分离到10株H6亚型禽流感病毒（AIV）毒株。为了解这10株病毒的神经氨酸酶基因（NA）的分子特征和差异，我们运用 RT-PCR对这10株H6亚型禽流感病毒的NA基因进行了扩增、序列测定及分析。序列测定结果显示，所分离的10株病毒均为H6N6亚型流感病毒。序列同源性分析结果表明A/DK/NN/6121/2013株的NA基因与其他9株NA基因差异性较大，差异性达到5.4%~5.9%，其余9株之间相似性在97.9%~100%；南宁与防城港、南宁与梧州以及梧州与防城港毒株相似性分别为94.5%~100%，94.1%~98.1%和97.8%~98.5%，这些数据表明不同毒株呈现一定的地域性差异。氨基酸序列分析发现10个毒株NA基因上潜在的糖基化位点也有所不同，表明这些毒株有异源性。遗传进化分析表明10株NA基因片段均属于欧亚谱系的禽源演化分支，除了南宁市的DK/NN/6121与福建相应毒株遗传进化关系较近外，其他9株与越南的相应毒株相互之间遗传进化关系都很亲近，且与越南A/duck/Vietnam/LBM235/2012(H3N6)株的NA基因存在很近的遗传关系，推测它们之间的基因可能存在基因交流；同时发现与台湾和韩国等的毒株关联不大。

鸭；禽流感病毒；H6亚型；NA；基因分析