芸薹属蔬菜Chs基因序列多态性  

陈发波 , 姚启伦 , 方平 , 董二飞 , 陈春
长江师范学院生命科学与技术学院, 重庆, 408100
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 399 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

为探讨我国芸薹属蔬菜的起源及遗传多样性,克隆、测序芸薹属不同种的Chs基因序列。A基因组二倍体、A基因组多倍体、B基因组多倍体和C基因组二倍体的Chs基因突变位点数分别为12017219425个,Chs基因多态性表现为:B基因组多倍体>A基因组二倍体>基因组多倍体>C基因组多倍体。Tajima,DFu and Li,DFu and Li,F检验表明A基因组二倍体、C基因组二倍体Chs 基因是中性进化基因。HKA平衡检验及误配分析表明A基因组多倍体和B基因组多倍体Chs基因进化中存在选择作用。A基因组和B基因组间存在较低的共有差异和较高的共有多态性,C基因组与A、B基因组存在较高的共有差异和较低的共有多态性。系统发育树将芸薹属Chs基因序列分成4个亚支、10个支系。网状分析表明,白菜可能是四倍体A基因组的供体,黑芥可能是四倍体B基因组的供体,甘蓝可能是四倍体C基因组的供体。中国芸薹属蔬菜在Chs基因位点有较高的遗传多态性,不同基因组间分化程度不一样,B基因组分化较大,AC基因组分化较小。AB基因组的亲缘关系较AC基因组以及BC基因组更为接近。建议根据基因组的不同将中国芸薹蔬菜分成白菜组、芥菜组和甘蓝组,研究结果支持芸薹属进化的禹式三角模型。

关键词
芸薹属;蔬菜;Chs基因;序列多态性
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基因组学与应用生物学
• 第 34 卷
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