胡文桥 , 侯越 , 张峰 , 刘宏德 , 孙啸

东南大学生物科学与医学工程学院, 生物电子学国家重点实验室, 南京, 210096
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 357 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

真核生物染色质在核内的空间组织形式能影响DNA的空间分布，因而对基因转录、DNA复制等生物学过程具有调节作用。目前对这种空间上高度有序的基因组结构的认识还是粗糙的、碎片式的和不完整的。近年，利用染色质构象捕获技术发展起来的衍生技术——Hi-C技术，是一种研究全基因组范围的染色质相互作用以及探明全基因组的三维结构的分析技术。利用Hi-C技术能够对染色质内部或所有染色质之间的相互作用进行精细分析，从而把基因表达调控引入到空间的、全局性的研究层面，为全面解析与DNA有关的生物学过程的机理开启新的契机。本文主要阐述染色质构象解析技术Hi-C的实验原理、数据处理以及染色质构象信息提取，包括染色质内相互作用情况分析、全基因组基因活性分类、拓扑关联结构域(TAD)和染色质环(chromatin loop)，介绍染色质构象信息与基因调控研究方面的国际前沿进展。

染色质构象捕获；Hi-C；染色质相互作用；拓扑关联结构域；染色质环