曾长英¹ , 周玉飞² , 彭明¹

1中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海口, 571101; 2贵州省亚热带作物研究所, 兴义, 562400
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2015 年, 第 34卷, 第 372 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

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通过实时定量PCR方法分析了miR395abcd与其靶基因ATRX在两个木薯品种的4种低温处理下的差异表达情况，靶基因的定量引物设计在与miRNA结合区的上游、结合边缘、结合区3个位置。结果显示miR395abcd与其靶基因在两个木薯品种、4种低温处理和3个靶基因引物位置的表达量均不同，且miR395abcd在C4和SC124两个品种间4种低温处理的6组两两比较中的相对表达量呈现完美的反向关系。进一步比较发现miR395abcd与靶基因的负相关性在C4中最好，尤其是位于miRNA与mRNA结合区上游的a引物的消长关系在AH (驯化后寒害: 25~14℃驯化5 d后再降至4℃)和NAH (非驯化寒害: 25℃直接降至4℃)中表现得最典型。具体而言，miR395abcd在C4的AH和NAH处理中上调而在SC124的AH和NAH处理中下调表达，前期表型分析中AH和NAH处理下C4的低温胁迫症状小于SC124，预示着miR395abcd的上调表达有利于木薯减轻低温伤害，其表达差异能够表征C4和SC124在耐低温性能的表型差异，且miR395abcd对其靶基因ATRX的调控在木薯低温响应过程中起着正向保护作用。

miR395abcd；靶基因；木薯；耐低温；差异表达分析