蓝莓磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因cDNA克隆及表达分析  

邵姁1 , 王月1 , 应炎标1 , 葛凡2 , 朱友银2 , 郭卫东1
1浙江师范大学, 浙江省特色经济植物生物技术研究重点实验室, 金华, 321004; 2金华职业技术学院, 农业与生物工程学院, 金华, 321007
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 16 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPCase, phosphoenolpyruvate carboxylase, EC4.1.1.31)在植物代谢过程中发挥重要作用。本研究从蓝莓果实中克隆到磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶编码基因VcPEPC。该基因开放阅读框全长为2 907 bp,可编码968个氨基酸,分子量为110.59 KD。由于该蛋白具有磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶结构特征,认为VcPEPC属于PEPcase家族(pfam00311)。二级结构预测表明,VcPEPC蛋白序列含有双螺旋(54.44%)、扩展链(11.67%)、β转角(6.71%)以及无规则卷曲(27.17%)。进化树分析发现VcPEPC与瓜、蓖麻和葡萄遗传距离较近。反转录PCR分析表明,VcPEPC基因在蓝莓根、茎、叶、花、果实中均有表达。在奥尼尔叶片中的表达量高于蓝丰、布里吉塔和夏普兰,在夏普兰绿色大果中表达量较高,成熟后,基因表达下调。

关键词
蓝莓;PEPC;克隆;表达
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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