广东海洋大学, 湛江, 524025
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 24 篇
收稿日期: 1970年01月01日 接受日期: 1970年01月01日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 24 篇
收稿日期: 1970年01月01日 接受日期: 1970年01月01日
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摘 要
肿瘤坏死因子受体相关因子7 (TRAF7)属于TRAFs家族,参与多种免疫炎症反应。为了研究马氏珠母贝TRAF7 (PmTRAF7)的生物学功能,本研究利用cDNA末端快速扩增(RACE)技术克隆获得PmTRAF7基因cDNA的全长序列并对其序列特征进行分析;同时利用荧光定量PCR (RT-PCR)技术检测了马氏珠母贝不同组织中PmTRAF7基因mRNA的表达。结果显示,PmTRAF7基因cDNA全长2 246 bp,开放阅读框(ORF) 1 809 bp,编码602个氨基酸,5'非翻译区(5'UTR)长211 bp,3'非翻译区(3'UTR)长226 bp,预测分子量约为67.50 KDa,理论等电点为6.56。多序列比对结果发现软体动物间TRAF7具有高保守性。软件分析结果显示PmTRAF7的氨基酸序列具有典型的RING结构、锌指结构和重复的WD4序列。荧光定量数据分析表明,PmTRAF7基因在血细胞、闭壳肌、外套膜、鳃、性腺和肝胰腺六种组织中均有表达,在肝胰腺中表达量最高,外套膜和鳃中表达量也较高。本研究可为进一步探究PmTRAF7在贝类免疫机制中的生物功能提供参考依据。
关键词
马氏珠母贝;TRAF7;基因克隆;荧光定量PCR
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