龙萄^1,2 , 黄春琼² , 刘国道²

1海南大学农学院, 海口, 570228; 2中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室, 儋州, 571737
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 28 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用，版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。

为了对狗牙根进行SSR-PCR分子标记分析，本研究对狗牙根的SSR-PCR反应体系进行了优化，利用L16(45)正交设计对狗牙根SSR-PCR反应体系中的Taq酶、Mg2+、dNTPs和引物4个因素的多个水平进行了筛选，PCR结果用SAS进行方差分析，并利用筛选出的最优体系对退火温度进行了筛选。结果表明：1) Taq酶、Mg2+和引物3个因素对狗牙根SSR-PCR扩增结果有极显著影响，影响程度为Taq酶>Mg2+>引物，而dNTPs对扩增结果影响不显著；2)筛选出了20 μL的狗牙根SSR-PCR最优反应体系为0.5 U Taq酶、2 mmol/L Mg2+、0.4 μmol/L引物、0.2 mmol/L dNTPs、30~60 ng模板DNA；3)退火温度50℃~62℃对本试验所选引物的SSR-PCR扩增结果影响不大，本研究选用55℃作为退火温度。

狗牙根(Cynodon dactylon (Linnaeus) Persoon)；SSR-PCR；正交设计；方差分析