周口师范学院, 生命科学与农学学院, 周口, 466001
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 89 篇
收稿日期: 2015年12月01日 接受日期: 2016年01月01日
作者 通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 89 篇
收稿日期: 2015年12月01日 接受日期: 2016年01月01日
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摘 要
PDAT酶催化磷脂和二脂酰甘油反应,生成溶血磷脂和三脂酰甘油,在三脂酰甘油合成过程中扮演着重要作用。为探明大豆PDAT基因的起源与进化关系,本研究利用生物信息学手段剖析了大豆PDAT基因的序列、表达以及进化关系。系统进化关系分析显示,除低等植物外,大豆与其他被子植物PDAT基因被分为4种类群,每一个类群内基因结构与保守基序组成模式均高度保守。基于滑动窗口与位点模型检测选择压力,结果显示大豆PDAT基因均受到功能限制,受控于负选择;但位点-分枝模型发现大豆与其他植物类群I和II的祖先分支发生了适应性进化。表达分析表明,大豆PDAT基因具有多样化的转录模式,且同源基因对之间存在分化。这些结果为进一步功能分析大豆PDAT基因提供了帮助。
关键词
大豆;磷脂;二酰甘油酰基转移酶;选择压力;表达;适应性进化
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