李龙 , 司景磊 , 吴延军 , 夏利 , 龙开旭 , 郭亚芬 , 兰干球

广西大学动物科学技术学院, 南宁, 530004
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 86 篇   
收稿日期: 2015年12月01日    接受日期: 2016年01月01日

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本研究旨在分析巴马小型猪TNF-α（tumor necrosis factor-alpha）基因的遗传变异情况。实验采用RT-PCR和克隆的方法成功扩增TNF-α基因的编码区序列，同时对TNF-α基因和相应的蛋白序列进行生物信息学分析。结果表明，巴马小型猪TNF-α基因编码区全长为699bp，编码232个氨基酸；与GenBank中已发表的猪TNF-α基因（登录号：NM_214022.1）序列进行比对，未发现核苷酸碱基突变；编码的232个氨基酸分子量为25253.9，理论等电点为5.44，不存在信号肽，但存在跨膜螺旋结构。TNF-α基因与人、马、牛、家犬、绵羊同源性比较结果表明其具有较强的保守性。巴马小型猪的TNF-α基因与野猪的亲缘关系一致。本实验研究结果为进一步研究TNF-α的生物学功能奠定理论基础。

巴马小型猪；TNF-α基因；基因克隆；序列分析；蛋白结构预测；同源性