马赛箭 , 安超 , 薛文娇 , 上官亦卿

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基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 117 篇   
收稿日期: 2016年02月01日    接受日期: 2016年03月01日

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为获得出芽短梗霉合成普鲁兰多糖的转录组信息，揭示出芽短梗霉生长发育过程中转录组的整体表达特征，本文采用Illumina HiSeq 2500平台对出芽短梗霉swp 35进行高通量测序，结合生物信息学方法开展基因表达谱研究和功能基因预测。通过测序、组装共得到29919条Transcript和20312条Unigene。所有Unigene与NCBI的非冗余蛋白质数据库(Nr)进行相似搜索(E值<10^-5)，结果一共有13,465个unigene与数据库中的已知基因同源。此外，还对Unigene 进行了GO、COG 和KEGG的功能注释、分类及通路分析，获得一批与普鲁兰多糖合成相关的基因。通过高通量测序，获得了丰富的出芽短梗霉合成普鲁兰多糖的转录组数据，为深入研究出芽短梗霉合成普鲁兰多糖的代谢调控提供了有价值的数据。

高通量测序；出芽短梗霉；转录组；基因注释