醛脱氢酶(ALDH)蛋白家族的信息学比较研究与修饰预测  

常凯1 , 童立冬2 , 江忠勇1 , 熊怡淞1 , 张睿1 , 熊杰1
1中国人民解放军成都军区总医院检验科, 成都, 610083; 2中国人民解放军成都军区总医院放射科, 成都, 610083
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 3 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日
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摘 要

以ALDH1~ALDH4为核心,利用生物信息学方法对比分析ALDH家族成员的蛋白理化性质、亚细胞定位,构建分析蛋白三维模型并绘制家族系统进化树。对不稳定蛋白进行修饰预测。结果表明:ALDH家族间的序列相似性较高但同源性相对较低,氨基酸序列差异较大。蛋白的GRAVY值(-0.284~0.01)和分子量(47974.0~61810.5)没有典型的规律性分布,但不稳定指数、脂肪系数和等电点差异显著。结构分析催化位点和结合区域有较大差异,这赋予了各家族成员不同的催化活性。最后就不稳定蛋白进行了理想的模拟突变与预测分析。分析结果可为ALDH蛋白的研究提供有价值信息,为进一步研究ALDH在人体内的疾病发生途径与作用机理提供依据。

关键词
醛脱氢酶;生物信息学;对比分析;蛋白特征;修饰预测
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基因组学与应用生物学
• 第 35 卷
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