詹光杰¹ , 黄发军² , 肖本见²

1湖北民族学院科技学院, 恩施, 445000; 2湖北民族学院医学院, 恩施, 445000
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 47 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日

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从GenBank下载多刺蚁属26个不同种的细胞色素C氧化酶亚基II(COXII)蛋白部分氨基酸序列进行分析，研究多刺蚁细胞色素C氧化酶亚基II的氨基酸序列变异和系统进化关系。多刺蚁属种间存在氨基酸变异位点84个，占总氨基酸数目的36%，而N端跨膜螺旋区氨基酸保守性最高。采用MEGA4.0构建的邻接法(NJ)系统发育树表明：佛瑞尔刺蚁(Polyrhachis foreli) 和甲胄刺蚁(Polyrhachis andromache)聚为一枝，双钩刺蚁(Polyrhachis bihamata)和叉形刺蚁(Polyrhachis ypsilon)聚为一枝，麦凯刺蚁(Polyrhachis mackayi)、澳洲刺蚁(Polyrhachis australis)和软毛刺蚁(Polyrhachis pilosa)三个种聚为一枝，这些种间亲缘关系较近；基于COXII蛋白序列的系统发育关系分析与基于细胞色素b蛋白的系统发育关系既存在一致性，也存在一定的差异。多刺蚁属中序列变异度最大的4个种的COXII对应的3D结构在螺旋和折叠排列方式上完全相同，表明多刺蚁属内COXII序列变异并不影响其结构的形成。

多刺蚁；线粒体；细胞色素c氧化酶亚基II；氨基酸序列；系统发育；3D结构