董昭桐 , 雷雅琪 , 陈淼林 , 余婧 , 朱璐 , 许杰

上海交通大学生命科学技术学院, 上海, 200240
作者    通讯作者
基因组学与应用生物学, 2016 年, 第 35卷, 第 98 篇   
收稿日期: 2015年12月01日    接受日期: 2016年01月01日

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水稻作为我国重要农作物，其营养生长和生殖发育过程都受到严格的生物钟的控制，因此，生物钟基因的表达变化也是决定水稻产量和种子质量的主要决定因素之一。为了更全面系统的了解生物钟基因在水稻生长和发育过程中的功能，本研究采用生物信息学共表达方法，筛选、鉴定和系统对比分析了生物钟基因在水稻和拟南芥中的类型和功能。从水稻表达谱公共数据库中筛选与生物钟基因表达密切相关732个基因，并对筛选出的水稻生物钟相关基因进行表达特性、节律性、生物功能预测及其与拟南芥的对比分析，结果表明水稻和拟南芥的生物钟基因可能都具有在生物钟核心振荡器部分功能相对保守的特点。 功能预测分析也还表明水稻生物钟基因参与了8类生物学过程，尤其在应激反应和代谢过程的方面具有明显富集性，从而间接佐证了水稻对于外界环境的响应及其代谢过程具有严格时间调控的分子机理。

水稻；生物钟；共表达分析；应激反应；代谢过程